头痛时选择核磁共振成像（MRI）还是计算机断层扫描（CT），需要考虑以下因素：
1.头痛原因：
颅内结构性病变：如肿瘤、血管畸形、脑积水等，MRI对软组织的分辨力较高，能更好地显示脑部结构，对于怀疑有颅内结构性病变的头痛，MRI是首选检查。
颅骨骨折、颅内积气等：CT对颅骨和脑部的骨性结构显示清晰，对于这些情况，CT更适合。
急性头痛：如果头痛突然发作，伴有意识障碍、恶心、呕吐等症状，CT可快速排除颅内出血等紧急情况，MRI则不适合作为首选。
2.其他因素：
检查时间：MRI检查时间较长，对于不配合或病情紧急的患者可能不太适合。
禁忌症：MRI对体内有金属植入物（如心脏起搏器、金属节育环等）的患者、幽闭恐惧症患者等可能不适用。CT检查有一定的辐射剂量，但通常较低，对于孕妇和儿童需要谨慎权衡利弊。
经济因素：MRI检查费用相对较高，而CT检查相对较便宜。
综上所述，对于头痛患者，医生会根据具体情况进行综合评估，选择最适合的检查方法。如果头痛原因不明或症状严重，可能需要进一步检查或结合其他检查方法来明确诊断。
在某些情况下，医生可能会建议同时进行MRI和CT检查，以获取更全面的信息。此外，还需要注意的是，头痛可能有多种原因，除了上述检查外，医生还可能会进行其他评估，如详细的病史采集、体格检查、神经系统检查等。
如果您有头痛症状，建议及时就医，遵循医生的建议进行检查和治疗。同时，保持良好的生活习惯，如充足的睡眠、健康的饮食、适度的运动等，也有助于缓解头痛。