先天性肌性斜颈的病因目前尚不完全清楚，可能与胎儿在子宫内的体位、遗传因素、难产以及某些致畸因素等有关，这些因素可能导致一侧颈部肌肉受到压迫、损伤或发育异常，进而引发先天性肌性斜颈。
先天性肌性斜颈的病因尚不完全清楚，目前认为可能与以下因素有关：
1.（一）子宫内压力异常：（1）如果胎儿在子宫内长期处于某种体位，（2）可能会导致一侧颈部肌肉受到过度的压迫，（3）从而影响该侧颈部肌肉的发育和血液供应，（4）最终导致先天性肌性斜颈。
2.（二）遗传因素：（1）有研究发现，（2）先天性肌性斜颈具有一定的家族遗传性，（3）如果家族中有成员患有此病，（4）那么其他成员患病的风险可能会增加。
3.（三）难产：（1）难产是导致先天性肌性斜颈的一个重要原因，（2）如果胎儿在分娩过程中受到过度的牵拉或挤压，（3）可能会损伤颈部肌肉和神经，（4）从而导致先天性肌性斜颈。
4.（四）其他因素：（1）胎儿在子宫内发育过程中，（2）如果受到某些致畸因素的影响，（3）也可能会导致颈部肌肉发育异常，（4）从而引发先天性肌性斜颈。