怀孕两周时进行性行为可能会有一些影响，但具体情况因人而异。以下是一些可能的情况：
1.流产：在怀孕早期，性行为可能会刺激子宫收缩，增加流产的风险。如果性行为过程中出现腹痛、阴道流血等异常情况，应及时就医。
2.感染：性行为可能会导致细菌或病毒感染，从而增加孕妇和胎儿感染的风险。如果孕妇出现发热、阴道分泌物异常等症状，应及时就医。
3.胎膜早破：胎膜早破是指在怀孕37周前胎膜破裂，这可能会导致早产和感染等问题。如果孕妇在性行为后出现羊水早破、阴道流液等症状，应立即就医。
需要注意的是，以上情况并不是一定会发生，而且每个人的身体状况和孕期情况都不同。如果孕妇在怀孕期间有任何疑虑或担忧，应及时咨询医生的意见。此外，在怀孕期间，孕妇应注意保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、避免吸烟和饮酒等，以确保自身和胎儿的健康。