怀孕两周时，孕囊可能还未到达宫腔，无法确定是否为宫内妊娠，也不能进行药流。药流需要在停经49天以内，且经B型超声确诊为宫内妊娠，并排除药流禁忌证后，在医生的指导下进行。药流后需要注意观察阴道出血情况，若出血量多或出血时间长，应及时就医。
怀孕两周通常不可以药物流产。
药流是通过药物而非手术终止早孕的一种避孕失败的补救措施。药流的适用范围是停经49天以内，尿妊娠试验阳性，B型超声确诊为宫内妊娠，这些情况可以进行药流。如果怀孕两周，通过末次月经计算停经时间是不准确的，因为孕囊可能还没有到达宫腔，所以无法确定是否为宫内妊娠，也不能进行药流。
药流前需要进行一系列的检查，包括血常规、白带常规、B型超声等，以排除药流的禁忌证。如果有以下情况，是不能进行药流的：
1.米非司酮禁忌证：肾上腺及其他内分泌疾病、妊娠期皮肤瘙痒史、血液病、血管栓塞病史、与甾体激素有关的肿瘤。
2.前列腺素禁忌证：心血管系统疾病、青光眼、哮喘、癫痫、结肠炎等。
3.过敏体质者。
4.带宫内节育器妊娠者。
5.可疑宫外孕者。
药流后需要注意观察阴道出血情况，如果出血量多或出血时间长，应及时就医。药流后还需要注意休息，加强营养，避免劳累和着凉，一个月内禁止性生活和盆浴。
总之，药流需要在医生的指导下进行，不能自行用药。如果怀孕两周，建议及时就医，进行相关检查，确定是否为宫内妊娠，然后再选择合适的流产方式。