一、胚胎因素
胚胎染色体异常是导致胎停的重要原因，包括染色体数目异常和结构异常。大量研究显示，约50%~60%的早期自然流产与胚胎染色体异常相关，如常见的三体综合征（如13-三体、18-三体、21-三体等）以及染色体结构缺失、易位等，这些异常会影响胚胎正常发育进而引发胎停。
二、母体因素
1.全身性疾病：严重感染（如弓形虫、风疹病毒等感染）、高热疾病可使胎盘血流减少、组织缺氧，导致胎停；严重贫血、心力衰竭等会造成胎盘灌注不足；血栓性疾病引发胎盘梗死或缺氧，均可能引起胎停。
2.内分泌异常：黄体功能不全可导致孕酮分泌不足，影响胚胎着床及发育；甲状腺功能减退会使机体代谢紊乱，干扰胚胎正常生长；糖尿病患者若血糖控制不佳，高血糖环境会影响胚胎发育，增加胎停风险。
3.免疫功能异常：自身免疫性疾病（如系统性红斑狼疮等）可产生自身抗体攻击胎盘组织；同种免疫异常表现为母胎免疫耐受失衡，导致胚胎被母体免疫系统攻击而发生胎停。
4.子宫解剖异常：子宫畸形（单角子宫、双角子宫等）会使宫腔形态异常，影响胚胎着床；宫腔粘连会减少子宫内膜面积，不利于胚胎种植；子宫肌瘤尤其是向宫腔内突出的黏膜下肌瘤，可影响胚胎着床及发育空间，增加胎停几率。
5.不良生活方式：孕妇长期吸烟、酗酒或过量饮用咖啡等，其中的有害物质会干扰胚胎发育进程，增加胎停发生的可能性。
三、父亲因素
父亲精子染色体异常也是胎停的潜在原因之一，虽然相对胚胎染色体异常导致胎停的比例较低，但精子染色体数目或结构异常可传递给胚胎，影响胚胎正常发育，从而引发胎停。
四、环境因素
过多接触放射线（如职业性长期接触高剂量射线）、化学物质（如苯、甲醛等）等环境因素，会损害胚胎细胞的遗传物质及正常代谢过程，干扰胚胎发育，增加胎停风险。