停经40天做B超看不到孕囊，可能是受孕时间较短、宫外孕、胚胎发育不良或其他因素所致，需结合其他检查综合判断，没有异常症状可一周后复查，有异常应及时就医。
停经40天做B超看不到孕囊，可能是以下原因。
1.受孕时间较短：虽然停经40天，但实际受孕时间可能较短，孕囊还未发育到可以通过B超看到的程度。
2.宫外孕：孕囊可能着床在子宫外，如输卵管、卵巢等部位，这种情况下B超也无法看到孕囊。
3.胚胎发育不良：孕囊虽然存在，但存在胚胎发育迟缓或停止的情况，导致孕囊小于停经天数。
4.其他因素：子宫肌瘤、子宫畸形等也可能影响孕囊的显示。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要结合临床症状、HCG水平、孕酮等检查结果综合判断。如果没有其他异常症状，可以在一周后复查B超，以确定孕囊的位置和发育情况。如果有腹痛、阴道流血等异常情况，应及时就医，排除宫外孕等危险情况。
此外，在等待复查的过程中，应注意休息，避免剧烈运动和性生活。如果对检查结果有疑虑或担忧，可与医生充分沟通，了解更多相关信息。