停经40天B超看不到孕囊，可能是受孕时间较短、宫外孕、胚胎发育异常或其他因素导致，医生会建议进行血HCG检测、孕酮检测、阴道超声等进一步检查，以确定孕囊位置和发育情况，并根据具体情况制定处理方案。
停经40天B超看不到孕囊可能是以下原因导致的。
1.受孕时间较短：孕囊可能还没有到达子宫腔，或者孕囊太小，B超无法检测到。
2.宫外孕：孕囊可能着床在子宫外，如输卵管、卵巢等部位，这种情况下B超也无法看到孕囊。
3.胚胎发育异常：如果孕囊存在发育问题，如胎停育等，也可能导致B超看不到孕囊。
4.其他因素：子宫肌瘤、子宫畸形等也可能影响孕囊的显示。
需要注意的是，停经40天看不到孕囊并不一定意味着存在问题，医生可能会建议进行进一步的检查，如血HCG检测、孕酮检测、阴道超声等，以确定孕囊的位置和发育情况。如果血HCG水平较低，且翻倍不良，宫外孕的可能性较大。如果阴道超声仍看不到孕囊，且血HCG持续升高，要警惕宫外孕或其他异常情况。
此外，医生还会根据具体情况进行评估，并制定相应的处理方案。如果确诊为宫外孕，需要及时治疗，以避免发生危险。如果是其他原因导致的看不到孕囊，医生会根据具体情况给出建议，如等待观察、进一步检查或治疗等。
总之，停经40天看不到孕囊需要引起重视，但也不必过于紧张。及时就医，遵循医生的建议进行进一步检查和处理，有助于确保母婴的健康。