一、感染性因素
1.尿道炎
-淋菌性尿道炎：主要由淋病奈瑟菌感染引起，多通过性接触传播。男性感染后，尿道会出现炎症反应，表现为尿道疼痛，同时可伴有尿道分泌物，初期为浆液性分泌物，逐渐变为脓性分泌物。在性活跃的年轻男性中较为常见，尤其是有不洁性行为史的人群。
-非淋菌性尿道炎：常见病原体为沙眼衣原体、解脲脲原体等。起病相对较缓，尿道疼痛程度一般较轻，尿道分泌物为浆液性或黏液性，量较少。性活跃的中青年男性是高发人群，与多个性伴侣或不安全性行为有关。
2.前列腺炎
-急性细菌性前列腺炎：多由细菌感染引起，如大肠埃希菌等。除了会出现尿频、尿急等排尿症状外，还可导致会阴部、耻骨上区疼痛，疼痛可放射至尿道，引起尿道疼痛。任何年龄段的男性都可能发病，但多见于中青年男性，身体抵抗力下降时易诱发。
-慢性细菌性前列腺炎：致病菌持续存在于前列腺内，炎症反复刺激尿道，导致尿道疼痛，同时可伴有排尿异常、会阴区不适等症状，病程较长，中老年男性也可能患病，与前列腺导管堵塞、细菌反复感染等因素有关。
3.膀胱炎蔓延：膀胱与尿道相邻，当膀胱发生感染，如膀胱炎时，炎症可能蔓延至尿道，引起尿道疼痛。膀胱炎常见病原体有大肠埃希菌等，中老年男性若存在前列腺增生等基础疾病，易引发膀胱炎并蔓延至尿道。
二、非感染性因素
1.尿道结石
-尿道结石可分为原发性和继发性，原发性尿道结石较少见，多为继发性，常来自上尿路结石。结石在尿道内移动时，会刺激尿道黏膜，引起尿道疼痛，疼痛性质多为刺痛或胀痛，同时可伴有排尿困难、血尿等症状。任何年龄段的男性都可能发生，男性尿道有三个狭窄部位，结石易停留在此处，长期饮水少、尿液浓度高的男性更易形成尿道结石。
2.尿道损伤
-外伤性尿道损伤：多因外界暴力引起，如骑跨伤等，会导致尿道黏膜、肌层损伤，出现尿道疼痛，同时有尿道口滴血、排尿困难等表现。中青年男性在进行剧烈运动或有危险行为时易发生尿道损伤，如骑跨在硬物上。
-医源性尿道损伤：多见于尿道器械检查或手术过程中，如膀胱镜检查等，操作不当可能造成尿道损伤，引起尿道疼痛，术后需密切观察排尿情况。任何接受尿道相关有创操作的男性都有发生医源性尿道损伤的可能，操作医生的技术水平和经验会影响损伤发生的几率。
3.尿道狭窄
-先天性尿道狭窄：多因尿道发育异常引起，如尿道外口狭窄等，可导致尿道梗阻，引起尿道疼痛，同时有排尿费力、尿线变细等表现，儿童时期可能就存在尿道狭窄的先天性因素。
-后天性尿道狭窄：常由尿道损伤修复不彻底、尿道炎症等引起，中老年男性相对多见，长期慢性炎症刺激可导致尿道纤维组织增生，引起尿道狭窄，进而出现尿道疼痛等症状。
4.化学性刺激
-长期留置导尿管的男性，尿管对尿道黏膜的刺激，或使用某些刺激性较强的药物灌注尿道等，可引起尿道疼痛。长期留置导尿管的中老年男性或因病情需要接受尿道药物灌注治疗的男性易出现这种情况。
5.过敏反应
-对某些物质过敏，如使用某些避孕套、尿道内灌注药物等，可引起尿道黏膜过敏反应，出现尿道疼痛，同时可能伴有尿道瘙痒、皮疹等表现，有过敏体质的男性更易发生。