一、对甲硝唑或吡咯类过敏患者禁忌
甲硝唑属于硝基咪唑类药物，吡咯类药物与人工牛黄甲硝唑中的成分可能存在交叉过敏反应，若患者对甲硝唑或吡咯类药物过敏，使用人工牛黄甲硝唑可能引发严重过敏反应，如过敏性休克、喉头水肿等，危及生命。
二、有活动性中枢神经疾病患者禁忌
人工牛黄甲硝唑中的成分可能会对中枢神经系统产生影响，对于患有活动性中枢神经疾病（如癫痫、格林-巴利综合征等）的患者，可能会加重中枢神经系统症状，干扰疾病的诊治，甚至诱发癫痫发作等严重情况。
三、血液病患者禁忌
人工牛黄甲硝唑可能会影响血液系统的正常功能，对于患有血液病（如白细胞减少症、血小板减少性紫癜等）的患者，使用后可能进一步影响血细胞的生成、功能或导致出血倾向加重等，不利于血液病的病情控制。
四、孕妇及哺乳期妇女禁忌
孕妇：人工牛黄甲硝唑中的甲硝唑可透过胎盘，动物实验发现甲硝唑对胎仔有毒性，虽然在人类中的影响尚不明确，但为避免可能对胎儿造成不良影响，孕妇禁用。
哺乳期妇女：甲硝唑可经乳汁排泄，婴儿摄入后可能引起不良反应，如胃肠道不适等，同时也可能影响哺乳期妇女自身的健康，故哺乳期妇女禁用。
五、儿童禁忌
由于儿童的肝、肾等器官发育尚未完善，对药物的代谢、排泄能力较弱，人工牛黄甲硝唑中的成分在儿童体内更容易蓄积，增加不良反应的发生风险，如神经系统毒性反应等，所以低龄儿童应避免使用，除非在医生权衡利弊后认为利大于弊且有明确用药指征时，才可谨慎使用，但需密切观察儿童用药后的反应。