功能性子宫出血的原因主要有以下几点：
1.全身性因素：
包括不良精神创伤、应激、营养不良、内分泌和代谢紊乱，如缺铁、贫血、再障性贫血、血液病和出血病、糖尿病、甲状腺和肾上腺疾病。
2.子宫和子宫内膜因素：
包括螺旋小动脉、微循环血管床结构和功能异常，内膜甾体受体和溶酶体功能障碍，局部凝血机制异常，和前列腺素PG代谢失调。
此外，子宫内膜不典型增生和子宫内膜癌也可能导致功能性子宫出血。
3.医源性因素：
包括甾体类避孕药、宫内节育器干扰正常HPOU轴功能。某些全身疾病的药物（尤以精神、神经系）可经神经内分泌机转影响正常月经功能。
4.其他：
包括有些患者，在卵泡期LH水平较低，导致卵泡发育缓慢，雌激素分泌减少，导致子宫内膜增生不足，出现功能性子宫出血。