大拇指根部肉厚部分疼可能由多种原因引起。
一、外伤因素
手指受到外力撞击、挤压等，如磕碰、重物砸到等，可能导致大拇指根部软组织损伤或骨骼损伤，从而引起疼痛，这种情况通常有明确的外伤史。
二、腱鞘炎
长期频繁使用大拇指，比如长时间打字、织毛衣、弹奏乐器等，容易引发拇指屈肌腱腱鞘炎。炎症刺激会导致大拇指根部疼痛，还可能伴有局部肿胀、活动时弹响等症状。常见于经常从事手部精细劳作的人群。
三、关节炎
类风湿关节炎、骨关节炎等疾病也可能累及大拇指关节，引起根部疼痛。类风湿关节炎多为对称性发病，除疼痛外还可能有关节肿胀、僵硬等表现；骨关节炎则多见于中老年人，与关节退变有关。
四、痛风
体内尿酸代谢异常，尿酸盐沉积在大拇指根部关节处，可引发急性痛风性关节炎，出现剧烈疼痛，局部还可能有红肿热等表现，通常在进食高嘌呤食物后容易诱发。