孕期同房后有褐色分泌物可能是以下原因引起的：
1.先兆流产：孕期同房可能刺激子宫收缩，导致先兆流产，出现褐色分泌物。此外，还可能伴有腹痛、腹部坠胀等症状。如果出现这些症状，应及时就医，医生一般会建议卧床休息，并使用黄体酮等药物进行保胎治疗。
2.前置胎盘：前置胎盘是孕期比较常见的一种并发症，指胎盘下缘部分或完全覆盖宫颈内口。同房时可能刺激子宫收缩，导致前置胎盘部分剥离，从而引起褐色分泌物或阴道出血。严重的前置胎盘还可能导致大出血，对孕妇和胎儿的生命安全造成威胁。如果孕期检查发现前置胎盘，应严格避免同房，并遵医嘱卧床休息，密切观察阴道出血情况。
3.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜局部增生形成的赘生物，质地脆弱，同房时容易因摩擦而导致息肉表面破损，引起出血，表现为褐色分泌物或白带带血丝。较小的宫颈息肉通常无明显症状，较大的息肉可能会引起白带增多、血性白带或接触性出血等。如果孕期检查发现宫颈息肉，且息肉较大或经常引起出血，医生一般会建议在孕期进行息肉摘除术。
4.其他原因：孕期同房后有褐色分泌物还可能与阴道炎、宫颈炎、胎盘早剥等其他原因有关。
总之，孕期同房后出现褐色分泌物需要引起重视，应及时就医，进行相关检查，明确原因，并在医生的指导下进行相应的治疗和处理。同时，孕期应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，避免同房，保持外阴清洁，勤换内裤。