胃肠道不适
部分人服用丙酮酸钙后可能出现胃肠道不适症状，如恶心、呕吐、腹痛、腹泻等。这是因为丙酮酸钙可能对胃肠道黏膜产生一定刺激，影响胃肠道正常的消化和吸收功能。例如，有研究显示，在一些临床试验中，约一定比例的受试者出现了不同程度的胃肠道不适表现。
影响矿物质代谢
长期或过量服用丙酮酸钙可能影响矿物质代谢。钙、磷等矿物质的代谢平衡可能被打破，干扰身体正常的生理功能。因为丙酮酸钙中的某些成分可能会与矿物质在体内的代谢过程产生相互作用，进而影响矿物质的吸收、转运和利用等环节。
对心血管系统的潜在影响
有研究表明，大剂量服用丙酮酸钙可能对心血管系统产生潜在影响。可能影响血压、心率等指标的稳定。不过一般正常剂量下这种影响相对较小，但对于本身有心血管基础疾病的人群，需要格外谨慎，因为其心血管系统的代偿能力可能较弱，服用后可能面临更大风险。
个体差异导致的副作用
不同个体对丙酮酸钙的耐受性不同，一些特殊人群如孕妇、哺乳期女性、肝肾功能不全者等，由于身体的生理状况特殊，更容易出现副作用。孕妇和哺乳期女性的身体处于特殊的生理阶段，肝肾功能不全者的代谢能力下降，这些因素都可能增加丙酮酸钙副作用发生的可能性，所以这类人群在考虑使用丙酮酸钙时需要更加谨慎评估风险。