丙酮酸钙可能存在一些副作用，比如部分人服用后可能出现胃肠道不适，像恶心、呕吐、腹痛等症状；也有少数人可能会出现头痛、头晕等情况；还有可能影响血糖水平，对于糖尿病患者等特殊人群需格外留意。
胃肠道不适方面
部分人群服用丙酮酸钙后会出现胃肠道反应，这是因为丙酮酸钙可能对胃肠道黏膜产生一定刺激，使得胃肠道蠕动或消化功能受到影响，进而引发恶心、呕吐、腹痛等表现，尤其是本身胃肠道功能较弱的人群更容易出现此类情况。
神经系统相关反应
少数人服用丙酮酸钙后可能出现头痛、头晕症状，这可能与药物对神经系统的影响有关，具体机制尚不完全明确，但一般在停药后可能会逐渐缓解，不过对于敏感人群来说需要密切关注自身反应。
对血糖的影响
丙酮酸钙有可能影响血糖水平，对于糖尿病患者或者血糖调节异常的人群，服用后需密切监测血糖变化，因为它可能会干扰体内的糖代谢过程，从而导致血糖波动，给病情控制带来一定影响。
特殊人群需注意
孕妇、哺乳期女性以及儿童等特殊人群在考虑使用丙酮酸钙时要格外谨慎。孕妇和哺乳期女性的身体处于特殊生理状态，药物可能会通过胎盘或乳汁影响胎儿或婴儿；儿童的身体发育尚未完全成熟，对药物的耐受和代谢能力与成人不同，一般不建议儿童随意服用丙酮酸钙，若有需求应在医生指导下谨慎使用。