长期过量食用螺旋藻可能带来一些健康风险。例如，可能会对甲状腺功能产生影响，有研究表明过量摄入螺旋藻可能干扰甲状腺激素的正常代谢。
可能影响营养平衡
长期吃螺旋藻可能打破体内原有的营养平衡状态。因为螺旋藻含有一定的营养成分，如果过度依赖它来获取营养，可能会导致其他食物摄入减少，进而使某些营养素缺乏，比如一些维生素或矿物质的摄取可能因之不足。
对消化系统有潜在影响
部分人长期食用螺旋藻后可能出现消化系统不适症状。比如可能会引起胃肠道的负担加重，出现腹胀、腹痛等情况，这是因为螺旋藻中的某些成分在过量摄入时，超出了胃肠道的正常消化吸收能力范围。
可能与药物发生相互作用
长期吃螺旋藻还可能与正在服用的药物产生相互作用。由于螺旋藻含有多种生物活性成分，这些成分有可能干扰药物的代谢过程，影响药物的疗效，甚至增加不良反应发生的风险，尤其是对于本身有基础疾病正在服药的人群而言，这种风险更需关注。
特殊人群需格外注意
对于孕妇、哺乳期女性以及有特定基础疾病（如甲状腺疾病等）的人群，长期吃螺旋藻可能带来更为复杂的健康问题。孕妇和哺乳期女性的身体处于特殊生理状态，螺旋藻的过量摄入可能影响胎儿或婴儿的健康；而本身有甲状腺疾病的人，螺旋藻可能进一步干扰甲状腺相关的生理机制，需要谨慎对待螺旋藻的长期食用。