滤泡增生性咽喉炎一般癌变几率较低，但也不能完全排除个别情况。
一、良性病变为主情况
滤泡增生性咽喉炎多是由于长期炎症刺激等因素导致咽喉部淋巴滤泡增生，其本质大多属于良性病变范畴，在常规炎症得到有效控制后，病情多能稳定，恶变风险相对小。
二、不良因素长期影响情况
若患者长期处于不良环境，如持续接触粉尘、化学刺激性物质，或有长期吸烟、酗酒等不良生活方式，会增加咽喉部黏膜的刺激，可能在一定程度上提高癌变的潜在风险，但这也并非绝对会癌变。
三、个体差异情况
不同个体之间存在差异，有的人体质对炎症等刺激的反应不同，一些免疫力较低或者有特殊基础病史的人群，相对而言癌变的可能性可能会有一定变化，但总体滤泡增生性咽喉炎癌变属于小概率事件。
四、及时干预情况
一旦发现有滤泡增生性咽喉炎，及时采取规范的治疗干预措施，如改善生活习惯、积极治疗相关炎症等，能有效降低可能出现的不良情况包括癌变的风险，所以患者不必过度恐慌但也需重视病情。