一、较深的伤口
较深的伤口内部可能存在较复杂的组织损伤，双氧水在分解过程中产生的气泡可能无法深入清洁到伤口深部，还可能破坏新生的组织细胞，不利于伤口愈合，所以较深的伤口不适合用双氧水。
二、已感染且有坏死组织的伤口
当伤口已经感染并且存在较多坏死组织时，双氧水的使用可能会刺激周围健康组织，同时不能很好地针对坏死组织进行有效处理，还可能干扰医生对伤口真实情况的判断，这类伤口不建议用双氧水。
三、新生儿的脐带残端伤口
新生儿的脐带残端皮肤娇嫩，双氧水的刺激性可能会引起新生儿不适，甚至影响脐带残端的正常愈合，所以新生儿脐带残端伤口不能用双氧水。
四、口腔内的伤口
口腔内有丰富的唾液等环境，使用双氧水可能会与口腔内的物质发生反应，产生不良刺激，而且口腔内伤口有其特殊的处理方式，一般不选择双氧水来处理。