细菌感染与病毒感染在多个方面存在区别。从病原体来看，细菌是单细胞生物，有细胞壁等结构；病毒则无细胞结构，由核酸和蛋白质外壳组成。
一、症状表现差异
细菌感染引发的症状往往相对局限，比如链球菌感染常导致局部的化脓性炎症，像化脓性扁桃体炎，会出现局部红肿、化脓等表现。而病毒感染引起的症状通常更具全身性，例如流感病毒感染，常出现高热、全身酸痛、乏力等较明显的全身症状。
二、实验室检查不同
血常规检查中，细菌感染时一般白细胞计数及中性粒细胞比例常升高；病毒感染时，白细胞计数多正常或降低，淋巴细胞比例可能升高。另外，通过病原学检测，细菌感染可通过培养等方法分离出细菌，病毒感染可通过核酸检测等发现病毒核酸。
三、治疗手段有别
细菌感染主要用抗生素治疗，不同的细菌感染可能选用不同的抗生素，如肺炎链球菌肺炎可选用青霉素类等抗生素。病毒感染一般以对症支持治疗为主，例如流感病毒感染，可使用抗病毒药物抑制病毒复制，但多数病毒感染靠人体自身免疫力清除病毒，需缓解症状来度过病程。
四、预后情况差异
大多数细菌感染在规范使用抗生素后预后较好，能较快康复。而病毒感染多数也有自限性，预后良好，但部分病毒感染可能引发严重并发症，如流感病毒感染可能导致肺炎等并发症，对特殊人群如老年人、儿童等影响较大，需密切关注。特殊人群中，儿童免疫力相对较弱，细菌或病毒感染时更需谨慎对待，及时就医，根据病情采取合适措施，老年人各器官功能减退，感染后更易出现严重情况，要加强监测和护理。