输卵管宫外孕主要与输卵管病变有关，如输卵管炎症，包括输卵管黏膜炎和输卵管周围炎，炎症会影响输卵管的正常蠕动和通畅性，阻碍受精卵正常运行至宫腔；输卵管手术史也是常见原因，曾行输卵管手术，如输卵管粘连分离术、输卵管成形术等，会使输卵管结构或功能改变，增加宫外孕风险；输卵管发育不良或功能异常，比如输卵管过长、肌层发育差、黏膜纤毛缺乏等，影响受精卵运送；受精卵游走，卵子在一侧输卵管受精后，经宫腔或腹腔进入对侧输卵管，由于移行时间过长，受精卵发育增大，就可能在对侧输卵管着床形成宫外孕。
输卵管炎症导致宫外孕
输卵管黏膜炎严重时可引起管腔完全阻塞导致不孕，轻者管腔变窄或纤毛功能受损，影响受精卵在输卵管内正常运行，使受精卵在输卵管内着床，引发宫外孕。比如女性有不洁性生活史等情况易引发输卵管黏膜炎，增加宫外孕发生几率。
输卵管手术史引发宫外孕
曾接受过输卵管相关手术，如输卵管妊娠手术、输卵管绝育术后复通术等，手术造成输卵管局部结构改变，术后输卵管可能存在粘连、狭窄等情况，影响受精卵正常运输，使受精卵在输卵管内着床，导致宫外孕。例如有过输卵管妊娠保守手术的女性，再次怀孕时宫外孕风险相对较高。
输卵管发育不良或功能异常致宫外孕
输卵管发育不良表现为输卵管过长、肌层发育差、黏膜纤毛缺乏等，这些异常使得输卵管运送受精卵的功能受影响，受精卵难以顺利到达宫腔，而在输卵管内停留着床。像先天性输卵管发育异常的女性，较易发生宫外孕。输卵管功能异常，比如内分泌失调影响输卵管蠕动等功能，也会干扰受精卵正常运行，增加宫外孕发生可能。
受精卵游走引发宫外孕
卵子在一侧输卵管受精后，经宫腔或腹腔进入对侧输卵管，若受精卵移行速度过慢，在到达宫腔前就已发育增大，就会在对侧输卵管着床形成宫外孕。比如一些女性输卵管蠕动功能稍差时，可能出现这种受精卵游走导致宫外孕的情况。