脑部核磁共振检查是一种相对安全的影像学检查方法，一般情况下对身体不会造成明显危害，但在某些特殊情况下可能存在一些需关注的点。
一、辐射方面的影响
脑部核磁共振检查利用的是磁场和射频脉冲，并非电离辐射，所以不存在辐射对身体细胞造成损伤的风险，这与CT检查依赖电离辐射不同，从辐射角度不会对身体产生危害。
二、对比剂使用相关情况
若进行增强脑部核磁共振检查，会使用对比剂，少数人可能对对比剂过敏，出现皮疹、瘙痒、呼吸困难等过敏反应，但这种情况发生概率较低，且医护人员会在检查前进行详细评估和预处理来降低风险。
三、对于特殊人群的影响
- 孕妇：一般来说，妊娠3个月内的孕妇应避免进行脑部核磁共振检查，因为虽然核磁共振相对安全，但仍有极少量不确定因素；而妊娠3个月后的孕妇，在必要时可在严格评估下进行检查，其受益通常大于潜在风险。
- 装有金属植入物者：如果体内装有心脏起搏器等金属植入物，通常不能进行脑部核磁共振检查，因为强磁场可能会干扰植入物的正常功能，而对于其他非磁性金属植入物，需要评估其与磁场的相容性后再决定是否能进行检查。