肛门指检一般不建议自己做。自行进行肛门指检可能因操作不当损伤肛门周围组织，且难以准确把握检查力度和位置。
非专业人士操作风险高
非医学专业人员缺乏专业的操作技巧和解剖知识，很难精准、轻柔地进行肛门指检，容易造成肛门局部的损伤，如擦伤、撕裂伤等，还可能遗漏一些关键的病变情况。
难以保证检查准确性
自己进行肛门指检时，由于缺乏专业工具辅助和规范的操作流程，很难准确触及到病变部位，也无法对肠道内的情况进行全面、细致的检查，不利于发现早期的肛门直肠疾病，如痔疮、肛瘘、直肠息肉、直肠癌等。
特殊人群不适合自行操作
对于儿童、老年人、体质虚弱或患有某些基础疾病（如心脏病、高血压等）的人群，自行进行肛门指检可能会引发不适甚至加重病情，这类人群更应由专业医护人员进行规范的肛门指检。