对大豆过敏者
大豆卵磷脂是从大豆中提取的，对大豆过敏的人群摄入后可能引发过敏反应，如皮肤瘙痒、皮疹、呼吸困难等，这类人群应避免使用大豆卵磷脂。
正在服用特定药物者
某些药物与大豆卵磷脂可能存在相互作用，比如正在服用抗凝血药物的人群，大豆卵磷脂可能影响血液凝固，增加出血风险，所以正在服用此类药物的人需谨慎使用大豆卵磷脂，使用前应咨询医生。
消化系统疾病患者
患有严重消化系统疾病，如胃溃疡、十二指肠溃疡等的人群，大豆卵磷脂可能对胃肠道产生刺激，加重病情，这类人群使用大豆卵磷脂需格外小心，最好在医生指导下决定是否使用。
儿童
目前针对儿童使用大豆卵磷脂的安全性和有效性研究相对有限，为保障儿童健康，不建议儿童随意使用大豆卵磷脂，如需使用应在专业医生的严格指导下进行。