头颅磁共振检查和头颅CT检查的区别主要在于成像原理、检查时间、检查禁忌症、对软组织的分辨力等方面，具体如下：
1.成像原理：头颅CT检查是利用X线束对头颅进行断层扫描，然后通过计算机处理重建出图像；而头颅磁共振检查则是利用磁场和无线电波来产生图像。
2.检查时间：头颅CT检查通常在几分钟内完成；头颅磁共振检查则需要较长的时间，一般在20分钟至1小时之间。
3.检查禁忌症：头颅CT检查对碘造影剂过敏、孕妇等人群需要谨慎；头颅磁共振检查对装有心脏起搏器、金属植入物、幽闭恐惧症患者等人群不适用。
4.对软组织的分辨力：头颅磁共振检查对软组织的分辨力更高，可以更好地显示脑部的灰质和白质、脑脊液、神经核团等结构；头颅CT检查对骨骼的分辨力更高，对于颅骨骨折、脑积水等病变的诊断更有优势。
5.其他方面：头颅磁共振检查没有辐射，对人体无损伤；头颅CT检查有一定的辐射，但剂量较低，对人体的影响较小。
综上所述，头颅磁共振检查和头颅CT检查各有优缺点，在临床应用中应根据具体情况选择合适的检查方法。如果需要进行头颅检查，建议在医生的指导下选择合适的检查方法，并遵循医生的建议进行检查前的准备和注意事项。