怀孕后选择对身体危害最小的流产方式和最佳手术时间如下：
1.危害最小的流产方式：药流和人流都有各自的风险和适用情况。药流适用于怀孕7周内的早期妊娠，但存在药流不全需要清宫的可能。人流则适用于怀孕10周内的早期妊娠，可通过负压吸引术或钳刮术进行。药流和人流都可能引起出血、感染、子宫穿孔等并发症，但在正规医院进行规范操作，这些风险可以降到最低。药流和人流的选择应根据孕周、孕囊大小、个人身体状况等因素综合考虑。医生会根据具体情况提供个性化的建议。
2.最佳手术时间：药流的最佳时间是怀孕49天内，人流的最佳时间是怀孕6-8周。过早进行药流或人流可能导致流产不全，过晚则可能增加手术难度和风险。在进行手术前，医生会进行详细的检查和评估，确定最佳的手术时间。