早上起来眼睛痛和流眼泪可能是由以下原因引起的：
1.感染：细菌、病毒或其他微生物感染眼睛，如结膜炎、角膜炎等，可能导致眼睛疼痛、红肿和流泪。
2.过敏：对空气中的花粉、灰尘、动物毛发等过敏，可能引起眼睛过敏反应，导致疼痛、瘙痒和流泪。
3.干眼症：眼睛表面缺乏足够的泪液，导致眼睛干燥、疼痛和流泪。
4.眼部刺激物：烟雾、化学物质、刺激性气体等进入眼睛，可能引起眼睛疼痛和流泪。
5.睡眠不足或用眼过度：长时间使用电子设备、熬夜、过度阅读等，可能导致眼睛疲劳和疼痛。
6.眼部损伤：眼部受到外伤、刮擦或异物进入等，可能导致眼睛疼痛和流泪。
7.其他原因：青光眼、虹膜炎、角膜炎等眼部疾病，或系统性疾病如糖尿病、类风湿性关节炎等，也可能引起眼睛痛和流眼泪。
如果出现早上起来眼睛痛和流眼泪的症状，建议采取以下措施：
1.保持眼部清洁：用温水轻轻清洗眼睛，避免使用刺激性的清洁剂或化妆品。
2.避免用眼过度：减少使用电子设备的时间，定期休息眼睛，避免长时间连续用眼。
3.保持充足睡眠：保证每天足够的睡眠时间，建立良好的睡眠习惯。
4.避免过敏原：尽量避免接触过敏原，如花粉、动物毛发等，如果需要外出，可以佩戴防护眼镜。
5.就医诊断：如果症状持续不缓解或加重，或伴有视力下降、眼红、分泌物增多等其他症状，应及时就医，进行详细的眼部检查，以确定病因并接受相应的治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考，如果症状严重或持续时间较长，建议及时就医，以便获得更专业的诊断和治疗。