脚底长硬疙瘩并伴有疼痛，可能是以下原因引起：
1.鸡眼：长期挤压和摩擦会导致脚底皮肤角质层增厚，形成鸡眼。鸡眼一般呈圆锥形，尖端向内，压迫神经时会引起疼痛。可以通过鸡眼贴、冷冻、激光等方法治疗。
2.跖疣：由人乳头瘤病毒感染引起，足底受压部位出现角化性丘疹，绿豆大小，表面粗糙，界限清楚，数目多，可逐渐增多，挤压时疼痛明显。可以通过冷冻、激光、电灼等方法治疗。
3.胼胝：长期受压和摩擦，导致皮肤角质层增厚，没有明显的炎症。一般没有疼痛，但是如果受到挤压，可能会引起疼痛。可以通过热水泡脚、修脚、外用角质剥脱剂等方法治疗。
4.骨刺：足跟骨刺是老年人常见的疾病，由于足底筋膜在跟骨的附着处过度牵拉骨膜，导致骨膜出现微小的撕裂，局部出现炎症，从而引起疼痛。可以通过服用非甾体类抗炎药、局部注射封闭、手术等方法治疗。
5.其他：脚底长硬疙瘩并伴有疼痛，还可能是其他原因引起，如肿瘤、感染等。
如果脚底长硬疙瘩并伴有疼痛，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。