宝宝牙齿最里面的牙肉肿起来，可能是由以下原因引起的：
1.萌出性龈炎：宝宝长牙时，牙肉会肿起来，这是正常的生理现象。一般不需要特殊处理，几天后会自行消退。可以给宝宝使用磨牙棒或牙胶，缓解牙龈不适。
2.感染：宝宝的口腔卫生不好，容易导致细菌感染，引起牙龈发炎、肿胀。可以用淡盐水给宝宝漱口，或者使用含有氯己定的口腔清洁剂。如果症状严重，需要在医生的指导下使用抗生素。
3.根尖周炎：如果宝宝的牙齿有龋齿或牙髓炎，没有及时治疗，可能会发展为根尖周炎，导致牙龈肿痛。需要及时就医，进行根管治疗。
4.牙周炎：宝宝的牙周组织受到炎症刺激，也会引起牙龈肿痛。需要注意口腔卫生，定期洗牙。
5.其他：维生素C缺乏、白血病等全身性疾病也可能导致牙龈肿痛。
如果宝宝的牙龈肿痛持续时间较长，或者伴有发热、口臭等症状，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持宝宝的口腔卫生，饭后及时漱口，早晚刷牙。