固肠胶囊和复方苦木消炎胶囊可以一起吃，但需要在医生的指导下使用。
固肠胶囊是一种中成药，主要成分有赤石脂、黄连、黄柏、诃子、延胡索、厚朴、罂.粟壳、木香。具有调和气血、涩肠止痛的功效，用于治疗脾肾阳虚所致的泄泻，症见大便不调、五更泄泻、时带黏液，伴腹胀腹痛、胃脘疼痛等。复方苦木消炎胶囊也是一种中成药，主要成分有穿心莲、苦木。具有清热解毒、燥湿止痢的功效，用于治疗细菌性痢疾、急性肠炎及各种急性感染性疾患。
虽然这两种药物都具有清热解毒的功效，但它们的成分和适应症略有不同。因此，在同时使用这两种药物时，需要在医生的指导下，根据具体病情和个体情况来决定用药剂量和用药时间，以避免药物之间的相互作用影响药效或产生不良反应。