卵巢成熟畸胎瘤和未成熟畸胎瘤的区别主要在于肿瘤的成熟度和恶性程度。
成熟畸胎瘤是一种良性肿瘤，占卵巢畸胎瘤的95%左右。它由三个胚层的成熟组织构成，包括皮肤、毛发、牙齿、骨骼、脂肪、神经组织等。成熟畸胎瘤通常为单侧单发，肿瘤表面光滑，包膜完整，多为囊性，少数为实性。瘤内可含有油脂、毛发、牙齿等多种组织成分。成熟畸胎瘤恶变的发生率较低，一般为2%~4%。
未成熟畸胎瘤是一种恶性肿瘤，占卵巢畸胎瘤的5%左右。它由未成熟的胚胎组织构成，多为实性，瘤组织分化不成熟，常有未分化的神经外胚层组织。未成熟畸胎瘤多为单侧卵巢受累，肿瘤体积较大，常为双侧性。未成熟畸胎瘤的恶性程度较高，复发和转移的风险较大，但对化疗敏感。
综上所述，卵巢成熟畸胎瘤和未成熟畸胎瘤的区别在于肿瘤的成熟度和恶性程度。成熟畸胎瘤是良性肿瘤，未成熟畸胎瘤是恶性肿瘤。治疗方法和预后也不同，成熟畸胎瘤通常采用手术治疗，预后较好；未成熟畸胎瘤需要手术联合化疗，预后较差。