头孢克肟胶囊和复方头孢克洛胶囊的不同之处在于：
1.药品成分：头孢克肟胶囊的主要成分是头孢克肟，复方头孢克洛胶囊则是头孢克洛与溴己新的复方制剂。
2.功效：两者均具有抗菌作用，但头孢克肟胶囊主要用于治疗敏感菌所致的呼吸、泌尿和胆道等部位的感染，复方头孢克洛胶囊不仅适用于上述感染，还适用于因敏感菌引起的急性支气管炎、慢性支气管炎急性发作及肺炎等的治疗。
3.适用症状：头孢克肟胶囊对链球菌属（肠球菌除外）、肺炎球菌、淋球菌、卡他布兰汉球菌、大肠杆菌、克雷伯杆菌属、沙雷菌属、变形杆菌属、流感杆菌中从头孢克肟感菌引起的以下感染有效，如：慢性支气管炎急性发作、急性支气管炎并发作细菌感染、支气管扩张合并感染、肺炎；肾盂肾炎、膀胱炎、淋球菌性尿道炎；急性胆道系统细菌性感染（胆囊炎、胆管炎）；猩红热；中耳炎、鼻窦炎。复方头孢克洛胶囊适用于因敏感菌引起的呼吸道疾病，如：急性咽炎、扁桃体炎、急性支气管炎、慢性支气管炎急性发作、肺炎等；以及耳鼻喉科、口腔科、皮肤及软组织感染等。
4.不良反应：头孢克肟胶囊和复方头孢克洛胶囊的不良反应都包括过敏反应、胃肠道反应、血液系统异常等，但复方头孢克洛胶囊还可能引起头痛、眩晕、嗜睡、恶心、呕吐、膀胱炎、肾盂肾炎、发热、皮疹等不良反应。
5.使用方法：头孢克肟胶囊为口服制剂，用水分散后口服或直接吞服。复方头孢克洛胶囊也为口服制剂，可直接吞服或置于适量温开水中，振摇后服用。
需要注意的是，对头孢菌素类抗生素过敏者禁用头孢克肟胶囊和复方头孢克洛胶囊。肾功能不全者、孕妇及哺乳期妇女慎用。肝功能减退者应慎用复方头孢克洛胶囊，因药物可经乳汁排出，哺乳期妇女使用时应暂停哺乳。