少女三个月没有来月经，可能是以下原因导致：
1.怀孕：如果少女有性生活，且没有采取有效的避孕措施，怀孕是导致停经的常见原因。可以通过验孕棒或早孕试纸进行初步检测，或者到医院进行B超检查和血液HCG检测，以确定是否怀孕。
2.多囊卵巢综合征：这是一种常见的内分泌疾病，主要表现为月经失调、高雄激素血症、卵巢多囊样改变等。除了停经外，还可能伴有多毛、痤疮、肥胖等症状。需要到医院进行激素六项检查和超声检查，以明确诊断。治疗方法包括药物治疗、手术治疗等。
3.内分泌失调：少女的生活习惯、环境变化、情绪波动等因素都可能影响内分泌系统，导致激素分泌异常，从而引起月经失调。例如，长期熬夜、过度节食、精神压力过大等都可能导致内分泌失调。此外，一些疾病，如甲状腺功能减退症、高泌乳素血症等，也可能导致月经失调。
4.其他因素：一些全身性疾病，如贫血、营养不良、慢性肝炎、肾炎等，以及一些妇科疾病，如子宫内膜结核、宫腔粘连等，也可能导致月经失调。
需要注意的是，少女三个月没有来月经，需要及时到医院就诊，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，少女要注意保持良好的生活习惯，避免熬夜、过度节食、精神压力过大等，保持心情愉悦，有助于月经的恢复。