12岁女孩内裤上有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.幼女外阴炎：如果女孩平时不注意外阴清洁，或受到尿液、粪便的污染，可能会导致外阴炎，出现外阴瘙痒、疼痛等症状，严重时还可能出现褐色分泌物。
2.阴道炎：幼女阴道炎比较少见，但如果女孩使用了不洁的卫生用品，或与他人共用浴盆、毛巾等，可能会导致阴道炎，出现阴道分泌物增多、异味、瘙痒等症状，有时也会表现为内裤上有褐色分泌物。
3.阴道异物：如果女孩将异物放入阴道内，可能会导致阴道损伤，出现褐色分泌物。
4.子宫内膜炎：如果女孩患有子宫内膜炎，可能会导致子宫内膜不规则脱落，出现阴道出血，表现为内裤上有褐色分泌物。
5.其他：女孩内裤上有褐色分泌物，还可能与内分泌失调、排卵期出血等有关。
如果女孩出现内裤上有褐色分泌物的情况，家长应及时带其就医，进行相关检查，如白带常规、B超等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意保持女孩外阴清洁，勤换内裤，避免使用不洁的卫生用品。