克罗恩病是一种良性疾病,小肠恶性淋巴瘤是一种恶性疾病,这两种疾病的鉴别诊断可以通过活检来进行的,也就是在肠镜下进行病变组织的取材,然后送往病理科进行化验,因为病理检查对确诊疾病的良恶性是非常准确的,也是目前对恶性肿瘤诊断的金标准。原发性小肠恶性淋巴瘤会较长时间的在小肠部位,存在多发性的病灶,而克罗恩病患者往往是有稳定期和发作期,也就是说患者有时是没有任何不适症状的,只有在疾病发作时才会出现右下腹部的疼痛、慢性腹泻等症状。这两个疾病在症状表现上有一定的相似之初,所以靠肠镜检查、病理活检是最好的鉴别诊断办法。