肠系膜动脉瘤的主要病因为感染，主要为真菌感染、细菌性心内膜炎，发病年龄多在50岁以下；其次为动脉硬化，以及中膜退行性变性、结节性动脉炎等，发病年龄多在50岁以上；此外，门静脉高压症、高血压、先天性动脉发育不良、外伤和医源性损伤等亦为该病发生的原因，但临床少见。