1.气管支气管囊肿

临床表现主要与其部位有关，位于隆突周围的囊肿可以在体积尚不大时即引起明显的临床表现，而其他部位的囊肿可以长到很大而仍无明显的临床表现。常见的临床表现包括呼吸困难（活动时尤为明显）、持续性咳嗽以及喘鸣，在儿童患者易误诊为哮喘、喘息性细支气管炎、气管支气管狭窄或气道异物等。囊肿与气道相通者易并发感染而出现相应的临床表现。个别病例囊肿可致气管阻塞或右心室流出道阻塞。

2．食管囊肿

食管囊肿多位于食管旁。多数患者无症状，少数因压迫食管而出现吞咽困难。部分患者可因慢性咳嗽而误诊为哮喘或慢性支气管炎。

3.胃肠囊肿

本病男性较常见。临床表现出现较早，多见于儿童期或更早期即有临床表现，包括疼痛、呼吸困难、咳嗽、呕吐、消瘦、咯血等，囊内的胃黏膜上皮细胞分泌酸性物质和某些蛋白酶使囊壁发生溃疡，并可累及邻近组织，在气管支气管和食管等部位形成瘘管，引起相应的临床表现。

4.心包囊肿

大多数心包囊肿不引起临床表现，仅于常规体检或因其他原因行胸部X线检查时被发现；个别患者因囊肿过大压迫邻近结构而产生胸骨后压迫感、呼吸困难或咳嗽等症状；极个别心包囊肿继发感染者。

5.胸腺囊肿

患者多为儿童和年轻人，大多无临床表现，仅于因其他原因行胸部X线检查时被发现。少数囊肿过大者可出现胸部疼痛或胀闷感、咳嗽、呼吸困难、吞咽困难、声嘶等症状。