萎缩性胃炎的症状多样，常见的有上腹部隐痛，约有50% - 80%的患者会出现这种情况，疼痛没有明显的规律，可为胀痛、隐痛等。另外，还可能有消化不良的表现，比如食欲不振，约30% - 50%的患者会有食欲下降的情况，进食后可能出现上腹部饱胀感，尤其是在进食较多食物后，饱胀感更为明显。
消化道症状表现
腹痛情况： 除了隐痛外，部分患者还可能出现烧灼样痛，进食刺激性食物后可能会加重。而且疼痛的程度个体差异较大，有的患者疼痛较轻，仅感觉腹部不适，有的则疼痛较为明显，影响日常生活。腹胀特点： 腹胀可在餐后较为突出，有时即使进食很少量的食物，也会感觉肚子很胀。而且这种腹胀可能持续较长时间，有的患者会持续数小时甚至一整天。
全身伴随症状
消瘦表现： 长期患有萎缩性胃炎的患者可能会出现消瘦，这是因为胃部消化功能受损，影响营养物质的吸收，一般经过数月到数年的时间，体重可能会逐渐下降，比如半年内体重下降5公斤以上。贫血症状： 部分患者可能出现贫血相关表现，如面色苍白，这是由于胃内铁等营养物质吸收障碍，导致缺铁性贫血等，还可能伴有头晕，活动后头晕症状可能会加重。
其他不典型症状
反酸情况： 约20% - 30%的患者会出现反酸，胃酸反流至食管，可引起胸骨后烧灼感。恶心呕吐： 少数患者会有恶心的感觉，严重时可能出现呕吐，呕吐物多为胃内的消化液，一般呕吐后腹部不适可能会有所缓解，但容易反复发作。