头孢克肟和头孢丙烯都是头孢类抗生素，但它们有一些区别。一般来说，头孢克肟对部分革兰阴性菌的抗菌活性相对较强，而头孢丙烯对部分革兰阳性菌的作用可能更突出。
抗菌谱方面
头孢克肟： 对链球菌属（肠球菌除外）、肺炎球菌、淋球菌、卡他布兰汉球菌、大肠杆菌、克雷伯杆菌属、沙雷菌属、变形杆菌属及流感杆菌等有较好的抗菌作用。比如对一些产酶流感杆菌有较好效果，常用于治疗由这些敏感菌引起的呼吸道感染、泌尿系统感染等，像支气管炎、肺炎、肾盂肾炎、膀胱炎等感染性疾病可能会用到它。头孢丙烯： 对金黄色葡萄球菌（包括产β-内酰胺酶菌株）、肺炎链球菌、化脓性链球菌等革兰阳性菌，以及流感嗜血杆菌（包括产β-内酰胺酶菌株）、卡他莫拉菌（包括产β-内酰胺酶菌株）等革兰阴性菌有抗菌活性。常用于治疗呼吸道感染，如肺炎、急性支气管炎等，还有皮肤和软组织感染等，像化脓性链球菌性咽炎/扁桃体炎、皮肤软组织感染等情况可能会使用头孢丙烯。
药代动力学方面
头孢克肟： 口服后吸收迅速，约40% - 50%被吸收。食物对其吸收影响不大，空腹口服吸收更好。血浆蛋白结合率约65%，半衰期约3 - 4小时。头孢丙烯： 口服吸收良好，生物利用度约为37%，进食可影响其吸收速度，但不影响吸收程度。血浆蛋白结合率约为36%，半衰期约为1.3 - 2.0小时。
不良反应方面
头孢克肟： 可能出现的不良反应有腹泻、皮疹、药物热等，少数人可能会出现血清氨基转移酶升高、嗜酸性粒细胞增多等。比如个别患者可能在用药后出现轻度的腹泻症状，一般症状较轻，但如果腹泻严重需及时就医。头孢丙烯： 常见的不良反应包括胃肠道反应，如腹泻、恶心、呕吐等，还有可能出现头痛、眩晕等，也有少数人会出现皮疹、荨麻疹等过敏反应。例如部分患者服用后可能会感觉轻微头痛，一般不影响继续用药，但如果头痛持续不缓解或加重则需留意。