月经干净后安全期的计算方法主要有日历法和基础体温法等。对于月经周期规律的女性，一般月经周期为28 - 30天，月经持续时间平均为3 - 7天，那么月经干净后安全期大概是从月经结束后的第1天开始算，到下次排卵前的3 - 5天。例如，月经持续5天，月经周期28天，那月经第6天到下次排卵前3天左右属于安全期。
日历法计算安全期
月经周期规律时：首先要明确自己的月经周期时长，比如月经周期是28天，从月经来潮第1天开始算，第1 - 7天是月经期，月经干净后第1天开始进入安全期计算。一般下次月经前14天左右是排卵日，排卵日的前5天和后4天加上排卵日共10天是排卵期，那么月经干净后安全期就是从月经结束后第1天到排卵前5天左右。例如月经周期30天，月经持续6天，那么月经第7天到下次月经前19天左右属于安全期。月经周期不规律时：日历法不太准确，因为排卵受多种因素影响，月经周期不规律的话，很难通过固定的日历来精准计算安全期，这时候可以结合其他方法综合判断。
基础体温法计算安全期
测量基础体温：每天清晨醒来后，在未进行任何活动前测量体温并记录。在月经周期中，排卵前基础体温较低，排卵后由于孕激素的作用，基础体温会升高0.3 - 0.5℃。当基础体温处于低温阶段时，月经干净后的安全期就包含在这个低温期内。比如，某女性连续测量基础体温，发现月经干净后一段时间内基础体温一直处于较低水平，且没有出现明显的体温上升，那么这段时间就属于安全期范围。但要注意，基础体温法需要连续测量多个周期才能更准确判断，而且如果体温测量不准确或者身体有其他因素影响（如感冒等），可能会导致判断误差。
宫颈黏液法计算安全期
观察宫颈黏液变化：在月经干净后，宫颈黏液量少、黏稠且浑浊。随着接近排卵期，宫颈黏液会变得稀薄、透明，像蛋清一样。当宫颈黏液处于量少、黏稠状态时，月经干净后的安全期就包含这个阶段。例如，月经干净后几天内，发现白带量少，质地黏稠，这时候就处于安全期。但要持续观察宫颈黏液的变化，如果发现宫颈黏液逐渐变得稀薄透明，那就接近排卵期了，安全期即将结束。不过这种方法也需要一定的经验来准确判断宫颈黏液的状态。