消化性溃疡最常见的症状是上腹部疼痛，约有70% - 80%的消化性溃疡患者会出现此症状。疼痛具有一定的规律性，比如十二指肠溃疡多表现为空腹痛，即餐后2 - 4小时开始出现，进食后缓解；而胃溃疡的疼痛多在餐后1小时内出现，1 - 2小时后逐渐缓解。
疼痛的性质与程度
隐痛或钝痛：消化性溃疡引起的疼痛一般为轻至中度的隐痛或钝痛，这种疼痛不像剧烈的刺痛或绞痛那么强烈，但能明显感觉到上腹部的不适。例如，很多患者描述为“闷闷的痛”“隐隐作痛”。烧灼样痛：部分患者会感觉上腹部有烧灼样的感觉，就好像有一团火在里面灼烧一样。这种烧灼样痛也是比较常见的疼痛表现形式。
疼痛的周期性特点
周期性发作：消化性溃疡的疼痛往往呈周期性发作。比如十二指肠溃疡，发作期可为数周，缓解期也可长达数月，如此反复交替。而胃溃疡的周期性相对没有十二指肠溃疡那么明显，但也会有发作和缓解的交替过程。在季节变化时，比如秋冬和冬春之交，疼痛更容易发作。
疼痛的影响因素
饮食影响：饮食对消化性溃疡的疼痛有明显影响。十二指肠溃疡患者在空腹时疼痛明显，进食后缓解，这是因为进食后胃酸被食物中和，对溃疡面的刺激减轻；而胃溃疡患者进食后，食物刺激胃酸分泌增加，从而导致疼痛发作。另外，食用辛辣、刺激性食物如辣椒、咖啡等，也容易诱发疼痛加重。精神因素：精神紧张、焦虑、情绪波动等精神因素也会影响疼痛程度。当人处于精神压力较大的状态时，会通过神经内分泌系统影响胃酸分泌等，进而使溃疡部位的疼痛加剧。比如长期处于高压工作环境中的人，消化性溃疡疼痛发作的频率可能会增加。