疲劳综合症常见的症状有很多，其中最典型的是持续或反复发作的极度疲劳，这种疲劳通常休息后也无法缓解，且会持续至少6个月以上。
一、身体方面的症状
1. 肌肉与骨骼症状： 患者常感到全身肌肉疼痛，尤其是颈部、肩部、背部等部位的肌肉容易出现酸痛感。同时，关节也可能会有不适，比如关节僵硬，在早晨起床时可能会感觉关节活动不灵活，这种关节问题可能会影响日常的行动，比如上下楼梯时会感到吃力。2. 睡眠障碍症状： 很多疲劳综合症患者会出现睡眠问题，有的人表现为难以入睡，躺在床上很久都无法进入睡眠状态；有的人则是睡眠质量差，即使睡着了也容易频繁醒来，导致整个睡眠过程不连贯，睡醒后依然感觉没有休息好，进而加重疲劳感。
二、神经系统方面的症状
1. 认知功能障碍症状： 患者会出现记忆力减退的情况，比如经常忘记刚刚发生的事情，像刚才把东西放在哪里了可能很快就记不起来。同时，注意力也难以集中，在工作或学习时很难长时间专注于一件事情，容易被外界干扰，导致工作或学习效率低下。2. 头痛症状： 头痛也是疲劳综合症常见的神经系统症状之一，头痛的程度和性质因人而异，有的是轻微的胀痛，有的则是较为剧烈的刺痛，而且这种头痛可能会持续存在，给患者带来持续的不适。
三、其他系统相关症状
1. 消化系统症状： 部分患者会出现消化系统的问题，比如食欲不振，对平时喜欢的食物也提不起兴趣，进食量明显减少。还可能伴有消化不良，吃了东西后感觉肚子胀，不容易消化，有时候会出现恶心的感觉，但一般不会有呕吐等严重的消化道反应。2. 免疫系统症状： 疲劳综合症患者的免疫系统可能会受到影响，表现为容易反复感冒，相比正常人更容易受到病毒或细菌的侵袭，感冒的频率明显增加，而且感冒后恢复的时间也可能会比正常人长。