肠胃功能紊乱的症状较多，常见的有消化不良，约有30% - 50%的肠胃功能紊乱患者会出现消化不良情况，表现为进食后上腹部饱胀、早饱感等。
消化系统症状表现
腹痛： 疼痛部位不固定，多为隐痛或胀痛，一般持续数分钟至数小时不等，有的患者疼痛会在排气或排便后有所缓解。腹胀： 患者常自觉腹部胀满，尤其在进食后更为明显，有时可伴有腹部膨隆的表现，持续时间可长可短。恶心呕吐： 部分患者会出现恶心症状，严重时可引发呕吐，呕吐物多为胃内未消化的食物。
全身伴随症状
失眠多梦： 约有20% - 30%的肠胃功能紊乱患者会出现睡眠问题，表现为入睡困难、多梦、易惊醒等，长期的失眠多梦会进一步影响患者的精神状态和日常生活。焦虑抑郁： 由于肠胃不适长期困扰，约15% - 25%的患者会出现不同程度的焦虑或抑郁情绪，患者可能会变得情绪低落、对事物缺乏兴趣、容易烦躁不安等。
肠道功能异常表现
腹泻： 有的患者会出现腹泻症状，大便次数增多，可为稀便或水样便，每天排便次数可能在3 - 5次甚至更多，尤其在进食生冷、刺激性食物后容易诱发。便秘： 部分患者则表现为便秘，大便干结、排便困难，每周排便次数少于3次，有的患者排便时还会感觉费力。