新生儿巨细胞病毒感染的治疗主要依靠抗病毒药物等手段。对于有症状的新生儿巨细胞病毒感染，更昔洛韦是常用的抗病毒药物之一。
抗病毒药物治疗
更昔洛韦： 是治疗新生儿巨细胞病毒感染的常用药物，它能抑制病毒DNA合成，从而发挥抗病毒作用。但需要注意其可能存在的一些副作用，如骨髓抑制等，在使用过程中需要密切监测血常规等指标。伐昔洛韦： 是更昔洛韦的前体药物，口服后在体内转化为更昔洛韦发挥作用，相对更昔洛韦来说，口服方便一些，但同样要关注其可能的不良反应。
对症支持治疗
呼吸支持： 如果新生儿巨细胞病毒感染导致呼吸功能受影响，出现呼吸急促、呼吸困难等情况，可能需要进行呼吸支持，如吸氧，严重时可能需要使用呼吸机辅助呼吸。一般根据新生儿的血氧饱和度等指标来决定吸氧的浓度和方式。营养支持： 保证新生儿充足的营养摄入很重要，对于吸吮能力差或喂养困难的新生儿，可能需要通过鼻饲等方式补充营养，保证热量、蛋白质等营养物质的供给，以维持新生儿正常的生长发育需求。
密切监测与随访
定期检查： 感染后需要定期对新生儿进行各项指标的检查，包括肝功能、血常规、听力等方面的检查。例如，一般建议在感染后定期复查肝功能，观察转氨酶等指标的变化情况；同时要定期进行听力筛查，因为巨细胞病毒感染可能会影响新生儿听力。长期随访： 新生儿巨细胞病毒感染可能会有远期影响，所以需要进行长期随访。随访时间可能会持续数年，关注新生儿的智力发育、生长发育等情况，以便及时发现可能出现的问题并进行干预。