眼睛结膜炎常见病因主要为细菌感染、病毒感染以及过敏，用药需依据病因决定，具体如下：
一、细菌感染导致的：
1.若眼睛结膜炎由细菌感染引起，需在医生指导下使用抗生素类滴眼液，如盐酸左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等，或使用抗生素类药膏，如红霉素软膏等，同时配合口服盐酸米诺环素胶囊、头孢氨苄胶囊等药物进行治疗。
二、病毒感染导致的：
1.若是病毒感染引发的眼睛结膜炎，则要在医生指导下使用抗病毒的滴眼液，如阿昔洛韦滴眼液、牛磺酸滴眼液、盐酸羟苄唑滴眼液等。若合并有细菌感染，还需配合口服盐酸左氧氟沙星胶囊、罗红霉素片等抗生素药物。
三、过敏导致的：
1.当眼睛结膜炎是由过敏造成时，需在医生指导下联合使用抗过敏类的滴眼液，如埃美丁滴眼液、奥洛他定滴眼液等，以及抗炎类滴眼液，如氟米龙滴眼液、他克莫司滴眼液、普拉洛芬滴眼液等进行治疗。
总结：对于眼睛结膜炎的治疗，要明确病因后选择合适的药物，细菌感染、病毒感染、过敏等不同病因用药各不相同，且都需在医生指导下进行，以确保治疗的有效性和安全性。