耳后疼痛的原因主要有以下三方面。首先，耳部本身的问题可能导致耳后疼痛，比如外耳道炎，它通常是由于细菌感染引起，约有30%左右的外耳道炎患者会出现耳后牵涉痛。还有中耳炎，当中耳发生炎症时，炎症可能会蔓延波及到耳后区域，引发耳后疼痛。
耳部疾病引发
外耳道炎： 多因细菌感染所致，除了耳后疼痛外，还可能伴有外耳道皮肤红肿、瘙痒、分泌物增多等表现。如果是游泳后未及时清理耳朵，就容易引发外耳道炎导致耳后疼痛。中耳炎： 通常是上呼吸道感染蔓延引起，除耳后疼痛外，还会有听力下降、耳鸣、耳朵流脓等症状。儿童由于咽鼓管短而宽，更容易患中耳炎进而出现耳后疼痛。
颈部疾病牵连
颈椎病： 长期低头工作、姿势不良等因素容易引发颈椎病。当颈椎病变刺激周围神经时，可能会放射到耳后导致疼痛。尤其是长时间使用电子设备的人群，患颈椎病的风险较高，约有15% - 20%的颈椎病患者会出现耳后牵涉痛。颈部淋巴结炎： 头颈部的感染可引起颈部淋巴结发炎，耳后淋巴结也可能受累，从而出现耳后疼痛。一般能摸到肿大的淋巴结，按压时疼痛会加剧，多由口腔炎症、头皮感染等引发。
神经方面问题
枕大神经痛： 枕大神经受到刺激或压迫时会引起疼痛，疼痛可放射至耳后部位。常表现为一侧耳后下方至颈部的阵发性刺痛或跳痛，受凉、劳累等因素可能诱发枕大神经痛。三叉神经痛： 三叉神经的分支受到影响时，也可能出现耳后区域的疼痛，疼痛通常较为剧烈，呈闪电样、刀割样，发作时间较短，但容易频繁发作。