乳头内陷主要是由多种因素引起的。一般来说，先天性发育异常是常见原因之一，约有20%的青春期女性可能存在不同程度的乳头内陷情况。
先天性发育异常导致
乳腺导管短缩： 在胚胎发育时期，乳腺导管发育出现异常，导致乳腺导管短缩，牵拉乳头，从而引起乳头内陷。这种情况从出生时就可能存在一定的潜在因素，但往往在青春期乳房发育时才较明显地表现出来。乳头平滑肌发育不良： 乳头部位的平滑肌发育不良，使得乳头缺乏正常的支撑结构，无法正常突出，进而出现内陷状况。
疾病因素引发
乳腺疾病： 某些乳腺疾病也可能导致乳头内陷，比如乳腺癌。乳腺癌细胞侵犯乳腺导管及周围组织，会引起导管挛缩，进而牵拉乳头，导致乳头内陷。不过这种情况相对较少见，但一旦出现需高度重视。炎症性疾病： 乳腺部位的炎症性疾病，如乳腺炎等，在炎症修复过程中，可能会造成乳头周围组织粘连、挛缩，影响乳头的正常位置，导致乳头内陷。
衣着因素影响
过紧的内衣： 长时间穿着过紧的内衣，尤其是青春期女性为了追求身材苗条而穿着过于紧身的胸罩，会过度压迫乳房，限制乳头的正常发育，久而久之容易引发乳头内陷。一般建议选择合适尺码、宽松舒适的内衣，避免过紧束缚。束胸： 一些不恰当的穿着习惯，如束胸，会严重影响乳房的正常发育，包括乳头的正常突出，增加乳头内陷的发生风险。
手术等后天因素
乳房手术： 乳房部位进行过手术，比如乳腺肿瘤切除手术等，如果手术操作涉及乳头周围组织，可能会损伤相关结构，导致乳头内陷。术后恢复过程中如果出现组织粘连等情况，也可能引发乳头内陷。