怀上葡萄胎的原因目前尚不十分明确，可能与以下因素有关。首先是营养因素，比如饮食中缺乏维生素A以及胡萝卜素和动物脂肪，可能会增加葡萄胎发生的几率。据研究发现，在以大米为主食的地区，葡萄胎的发生率相对较高。
染色体异常方面
完全性葡萄胎： 染色体核型大多为二倍体，全部来自父系染色体，常见的是46XX，少数为46XY。这是因为卵子受精时，精子携带的染色体替代了卵子的染色体，导致染色体异常。部分性葡萄胎： 染色体核型通常为三倍体，最常见的核型是69XXY，是由于一个正常卵子与两个精子受精，或者一个正常精子与减数分裂失败的卵子受精所致，从而造成染色体数目和结构的异常。
内分泌失调因素
激素水平异常： 体内的促性腺激素尤其是绒毛膜促性腺激素（hCG）水平异常对于葡萄胎的发生有重要影响。如果女性体内hCG分泌过多，可能会干扰正常的胚胎发育过程，导致滋养细胞增生，进而引发葡萄胎。例如，正常妊娠时hCG会随着孕周增长而有规律地上升，而葡萄胎患者的hCG水平远高于正常妊娠同期水平，且持续不降或持续上升。卵巢功能紊乱： 卵巢功能不正常会影响卵子的质量和排卵等过程，进而影响受精卵的发育。如果卵巢排卵出现异常，或者黄体功能不足等情况，都可能增加葡萄胎发生的风险。比如，一些患有多囊卵巢综合征的女性，本身存在内分泌紊乱，其发生葡萄胎的几率可能相对高于正常女性。
既往葡萄胎史因素
再次发生风险： 如果女性曾经有过葡萄胎病史，那么再次发生葡萄胎的风险会明显增加。有研究表明，一次葡萄胎妊娠后，再次葡萄胎妊娠的发生率约为1% - 2%；而两次葡萄胎妊娠后，再次发生的风险会升高到15% - 20%。这是因为既往葡萄胎妊娠可能导致子宫内环境发生改变，或者机体对滋养细胞的调控机制出现异常，使得再次妊娠时更容易出现葡萄胎。