跑步时上腹部疼痛可能由以下原因引起：
1.腹部肌肉痉挛：在跑步过程中，腹部肌肉需要不断收缩和放松，如果运动强度过大或时间过长，可能导致腹部肌肉疲劳和痉挛，从而引起疼痛。
2.呼吸方式不正确：不正确的呼吸方式可能导致腹部肌肉过度紧张，增加腹部压力，从而引起疼痛。建议采用深呼吸和有规律的呼吸方式，避免过度用嘴呼吸。
3.内脏器官问题：上腹部疼痛也可能与内脏器官有关，如胃、十二指肠、胰腺等。这些器官的疾病或炎症可能在跑步时加重，导致疼痛。
4.饮食问题：在跑步前或跑步过程中进食过多、过快或食用不易消化的食物，可能导致胃部不适和疼痛。
5.缺乏热身和拉伸：跑步前没有充分热身和拉伸，身体各部位的肌肉和关节没有准备好，容易引起疼痛。
6.身体疲劳或过度训练：身体疲劳或过度训练时，肌肉的耐力和恢复能力下降，容易出现疼痛和损伤。
7.其他因素：如肋骨骨折、胸膜炎等。
如果跑步时上腹部疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如呕吐、发热等，建议及时就医，进行详细的检查和诊断。同时，为了预防跑步时上腹部疼痛的发生，可以采取以下措施：
1.逐渐增加跑步强度和时间，避免过度训练。
2.注意饮食健康，避免在跑步前或跑步过程中进食过多、过快或食用不易消化的食物。
3.保持正确的跑步姿势，避免身体过度前倾或后仰。
4.跑步前进行充分的热身和拉伸，活动全身关节。
5.注意呼吸节奏，采用深呼吸和有规律的呼吸方式。
6.给身体足够的休息时间，让肌肉和关节恢复。
7.如果有其他健康问题，应在医生的指导下进行运动。
以下是一些可能有助于缓解上腹部疼痛的药物，如对乙酰氨基酚、布洛芬等，但具体用药应根据个人情况在医生的指导下使用。