新生儿败血症主要是由细菌感染引起的，其中最常见的致病菌是葡萄球菌，其次是大肠埃希菌等。据统计，新生儿败血症中约有30% - 50%是由葡萄球菌导致的。
感染途径之产前感染
宫内感染： 母亲在孕期有感染，比如孕妇有泌尿系统感染等情况，细菌可通过胎盘传播给胎儿，从而引发新生儿败血症。母亲如果有羊膜腔感染，胎儿吸入被细菌污染的羊水，也可能在宫内就受到感染。胎膜早破： 当胎膜早破时间超过12 - 24小时，细菌容易从阴道上行感染胎儿，增加新生儿患败血症的风险。一般来说，胎膜早破超过24小时，新生儿感染败血症的概率会明显升高。
感染途径之产时感染
产程延长： 产程延长会使胎儿暴露在细菌污染环境中的时间增加，细菌容易通过产道侵入胎儿体内。比如产程超过24小时，胎儿受到细菌感染引发败血症的可能性增大。助产操作不规范： 如在接生过程中，器械消毒不严格等，细菌可能通过产道损伤处进入胎儿体内，导致新生儿败血症。如果接生时使用的器械没有经过严格的灭菌处理，就可能将细菌带入新生儿体内。
感染途径之产后感染
脐部感染： 新生儿的脐部是细菌容易侵入的部位，如果脐部护理不当，如脐部被尿液、粪便污染，或者脐带残端没有保持干燥清洁，细菌就会在脐部繁殖并侵入血液，引发败血症。通常新生儿出生后1周内，脐部感染是导致败血症的常见原因之一。皮肤黏膜感染： 新生儿的皮肤比较娇嫩，容易破损，若皮肤破损后没有及时处理，细菌可通过破损处进入血液。比如新生儿的尿布疹没有及时治疗，破损的皮肤处细菌滋生，就可能引发败血症。另外，口腔黏膜损伤等也可能让细菌进入血液，引起感染。