毛囊炎的治疗药物需根据病情等选择，一般来说，外用药物和口服药物是常用的治疗方式。对于较轻的毛囊炎，外用药物可能就有较好效果，比如2%莫匹罗星软膏，它能抑制细菌生长，帮助消除炎症。
外用药物治疗
抗生素类外用药： 像夫西地酸乳膏就是常用的，它可以干扰细菌蛋白质合成，从而发挥抗菌作用，适用于细菌感染引起的毛囊炎。还有复方多粘菌素B软膏，能通过抑制细菌关键酶的活性来杀菌，对毛囊炎有一定治疗作用。抗真菌类外用药： 如果是真菌性毛囊炎，可使用酮康唑乳膏，它能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌代谢，达到抗真菌效果。联苯苄唑乳膏也能抑制真菌的麦角固醇合成，对由真菌感染导致的毛囊炎有治疗作用。
口服药物治疗
抗生素类口服药： 当毛囊炎比较严重，外用药物效果不佳时，可能会用到口服抗生素。比如头孢呋辛酯，它是广谱抗生素，能抑制细菌细胞壁的合成，从而起到杀菌消炎作用，可用于治疗细菌感染较重的毛囊炎。阿莫西林克拉维酸钾也是常用的，它能通过破坏细菌细胞壁来杀灭细菌，对毛囊炎有治疗功效。抗真菌类口服药： 如果是顽固的真菌性毛囊炎，可能需要口服抗真菌药，像伊曲康唑，它可以抑制真菌细胞色素P450酶系统，影响真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用，但使用时要注意可能对肝脏有一定影响，需在医生监测下使用。
注意事项
对于儿童患毛囊炎，使用药物要格外谨慎，一般尽量先选择刺激性小的外用药物。孕妇患毛囊炎用药也需特别小心，应在医生指导下选择对胎儿影响小的药物。同时，在治疗毛囊炎过程中，要注意保持皮肤清洁，避免搔抓，防止感染扩散。如果毛囊炎反复发作，要及时就医，排查是否有其他基础疾病等因素影响。