儿童肠胃炎用药需谨慎，一般可使用益生菌调节肠道菌群，比如枯草杆菌二联活菌颗粒等，能在一定程度上缓解症状。通常来说，针对儿童肠胃炎的药物选择要根据具体病情来定。
益生菌类药物
调节肠道菌群： 像枯草杆菌二联活菌颗粒，它含有枯草杆菌和肠球菌等有益菌，可补充肠道正常菌群，抑制有害菌生长，有助于改善儿童肠胃炎引起的肠道功能紊乱。一般适用于因肠道菌群失调导致的肠胃炎。双歧杆菌三联活菌散： 其中包含长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌，能调节肠道菌群平衡，对儿童肠胃炎有一定的辅助治疗作用，可缓解腹泻、腹胀等症状。
止泻类药物
蒙脱石散： 它可以覆盖在肠道黏膜表面，吸附病原体和毒素，起到止泻作用。儿童肠胃炎出现腹泻症状时可使用，比如孩子每天腹泻次数较多，大便较稀，就可以考虑服用。但要注意按合适的剂量服用，避免过量导致便秘等情况。药用炭胶囊： 能吸附肠道内的气体、细菌和毒素等，减少对肠道的刺激，从而达到止泻目的。不过儿童使用时要在医生指导下，根据年龄和病情来确定是否适用及具体用量。
补液类药物
口服补液盐Ⅲ： 儿童肠胃炎容易出现脱水和电解质紊乱，口服补液盐Ⅲ可以补充水分和钠、钾等电解质。当孩子有轻度脱水症状，比如尿量稍减少、口唇稍干等情况时，可按说明书配制后让孩子服用，预防和纠正脱水。一般每袋按规定加入适量温水溶解后给孩子服用。葡萄糖氯化钠注射液： 在儿童肠胃炎导致严重脱水时，可能需要静脉补充葡萄糖氯化钠注射液来补充水分和能量，维持电解质平衡，但这需要医生根据孩子的具体脱水程度等来判断是否使用及用量。